Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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FOXE3Q13461 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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FOXE3Q13461 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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FOXE3Q13461 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
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