Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFCP2Q12800 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms