Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms