Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms