Protein–RNA interactions for Protein: Q0PNE2

ELP6, Elongator complex protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP6Q0PNE2 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELP6Q0PNE2 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms