Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms