Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.7 ms