Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms