Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms