Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms