Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BNC1Q01954 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
BNC1Q01954 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BNC1Q01954 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
BNC1Q01954 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BNC1Q01954 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BNC1Q01954 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BNC1Q01954 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
BNC1Q01954 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BNC1Q01954 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BNC1Q01954 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BNC1Q01954 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BNC1Q01954 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BNC1Q01954 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BNC1Q01954 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BNC1Q01954 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BNC1Q01954 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BNC1Q01954 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
BNC1Q01954 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BNC1Q01954 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BNC1Q01954 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BNC1Q01954 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms