Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 AC084866.2-201ENST00000509956 449 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MDM2Q00987 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms