Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms