Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms