Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms