Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms