Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
SMARCA2P51531 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.6 ms