Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJA8P48165 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJA8P48165 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJA8P48165 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJA8P48165 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJA8P48165 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJA8P48165 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJA8P48165 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJA8P48165 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GJA8P48165 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJA8P48165 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJA8P48165 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJA8P48165 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJA8P48165 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJA8P48165 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJA8P48165 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJA8P48165 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJA8P48165 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJA8P48165 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJA8P48165 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJA8P48165 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJA8P48165 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJA8P48165 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJA8P48165 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJA8P48165 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJA8P48165 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJA8P48165 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJA8P48165 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GJA8P48165 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA8P48165 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA8P48165 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA8P48165 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA8P48165 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA8P48165 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA8P48165 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA8P48165 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA8P48165 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA8P48165 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA8P48165 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA8P48165 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA8P48165 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA8P48165 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA8P48165 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA8P48165 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA8P48165 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA8P48165 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA8P48165 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA8P48165 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA8P48165 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA8P48165 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA8P48165 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA8P48165 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA8P48165 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA8P48165 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA8P48165 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA8P48165 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA8P48165 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA8P48165 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA8P48165 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA8P48165 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA8P48165 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA8P48165 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA8P48165 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA8P48165 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA8P48165 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA8P48165 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA8P48165 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA8P48165 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA8P48165 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA8P48165 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA8P48165 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA8P48165 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA8P48165 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA8P48165 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA8P48165 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA8P48165 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA8P48165 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJA8P48165 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJA8P48165 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJA8P48165 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJA8P48165 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJA8P48165 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJA8P48165 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJA8P48165 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJA8P48165 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GJA8P48165 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJA8P48165 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJA8P48165 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJA8P48165 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJA8P48165 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJA8P48165 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJA8P48165 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GJA8P48165 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJA8P48165 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GJA8P48165 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJA8P48165 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJA8P48165 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJA8P48165 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJA8P48165 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJA8P48165 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms