Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms