Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CASP1P29466 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CASP1P29466 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CASP1P29466 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CASP1P29466 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP1P29466 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP1P29466 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP1P29466 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP1P29466 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP1P29466 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP1P29466 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP1P29466 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP1P29466 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP1P29466 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP1P29466 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP1P29466 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP1P29466 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP1P29466 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP1P29466 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP1P29466 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP1P29466 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP1P29466 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP1P29466 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP1P29466 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP1P29466 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP1P29466 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP1P29466 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP1P29466 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP1P29466 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP1P29466 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP1P29466 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP1P29466 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP1P29466 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP1P29466 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP1P29466 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP1P29466 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP1P29466 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP1P29466 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP1P29466 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP1P29466 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP1P29466 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP1P29466 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP1P29466 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP1P29466 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP1P29466 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP1P29466 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP1P29466 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP1P29466 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP1P29466 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP1P29466 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP1P29466 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP1P29466 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP1P29466 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP1P29466 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP1P29466 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP1P29466 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP1P29466 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP1P29466 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP1P29466 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP1P29466 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP1P29466 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP1P29466 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP1P29466 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP1P29466 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP1P29466 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP1P29466 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP1P29466 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP1P29466 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP1P29466 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP1P29466 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP1P29466 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP1P29466 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP1P29466 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP1P29466 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP1P29466 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP1P29466 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP1P29466 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP1P29466 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP1P29466 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP1P29466 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP1P29466 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP1P29466 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP1P29466 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP1P29466 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP1P29466 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP1P29466 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP1P29466 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP1P29466 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP1P29466 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASP1P29466 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASP1P29466 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASP1P29466 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASP1P29466 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASP1P29466 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASP1P29466 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASP1P29466 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASP1P29466 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASP1P29466 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASP1P29466 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASP1P29466 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms