Protein–RNA interactions for Protein: P29279

CTGF, Connective tissue growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTGFP29279 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTGFP29279 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTGFP29279 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTGFP29279 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTGFP29279 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTGFP29279 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTGFP29279 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTGFP29279 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CTGFP29279 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTGFP29279 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTGFP29279 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CTGFP29279 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTGFP29279 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTGFP29279 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTGFP29279 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTGFP29279 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTGFP29279 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTGFP29279 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTGFP29279 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTGFP29279 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTGFP29279 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTGFP29279 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTGFP29279 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTGFP29279 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTGFP29279 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTGFP29279 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTGFP29279 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTGFP29279 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTGFP29279 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTGFP29279 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTGFP29279 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTGFP29279 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTGFP29279 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTGFP29279 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTGFP29279 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTGFP29279 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTGFP29279 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTGFP29279 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTGFP29279 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTGFP29279 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTGFP29279 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CTGFP29279 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTGFP29279 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTGFP29279 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTGFP29279 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTGFP29279 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTGFP29279 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CTGFP29279 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CTGFP29279 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CTGFP29279 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTGFP29279 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTGFP29279 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTGFP29279 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTGFP29279 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTGFP29279 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTGFP29279 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTGFP29279 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CTGFP29279 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTGFP29279 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTGFP29279 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTGFP29279 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTGFP29279 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CTGFP29279 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTGFP29279 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTGFP29279 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTGFP29279 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTGFP29279 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTGFP29279 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTGFP29279 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTGFP29279 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTGFP29279 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTGFP29279 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTGFP29279 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTGFP29279 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTGFP29279 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTGFP29279 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTGFP29279 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTGFP29279 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTGFP29279 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTGFP29279 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTGFP29279 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTGFP29279 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTGFP29279 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTGFP29279 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTGFP29279 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTGFP29279 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTGFP29279 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTGFP29279 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTGFP29279 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTGFP29279 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTGFP29279 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CTGFP29279 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTGFP29279 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTGFP29279 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTGFP29279 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTGFP29279 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTGFP29279 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTGFP29279 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTGFP29279 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTGFP29279 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms