Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB2P29033 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB2P29033 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB2P29033 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB2P29033 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB2P29033 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB2P29033 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB2P29033 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB2P29033 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB2P29033 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB2P29033 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB2P29033 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB2P29033 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB2P29033 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB2P29033 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB2P29033 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB2P29033 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB2P29033 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB2P29033 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB2P29033 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB2P29033 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB2P29033 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB2P29033 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB2P29033 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB2P29033 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB2P29033 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB2P29033 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB2P29033 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJB2P29033 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJB2P29033 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJB2P29033 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJB2P29033 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJB2P29033 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJB2P29033 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJB2P29033 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJB2P29033 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJB2P29033 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJB2P29033 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJB2P29033 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJB2P29033 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJB2P29033 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJB2P29033 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJB2P29033 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJB2P29033 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJB2P29033 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GJB2P29033 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GJB2P29033 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJB2P29033 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJB2P29033 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GJB2P29033 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GJB2P29033 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJB2P29033 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJB2P29033 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GJB2P29033 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJB2P29033 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJB2P29033 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJB2P29033 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJB2P29033 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJB2P29033 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJB2P29033 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJB2P29033 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJB2P29033 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJB2P29033 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJB2P29033 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJB2P29033 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GJB2P29033 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
GJB2P29033 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GJB2P29033 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJB2P29033 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJB2P29033 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJB2P29033 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJB2P29033 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJB2P29033 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJB2P29033 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJB2P29033 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJB2P29033 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJB2P29033 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJB2P29033 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GJB2P29033 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJB2P29033 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJB2P29033 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJB2P29033 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJB2P29033 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJB2P29033 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJB2P29033 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GJB2P29033 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJB2P29033 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJB2P29033 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJB2P29033 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJB2P29033 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJB2P29033 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJB2P29033 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJB2P29033 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJB2P29033 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJB2P29033 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJB2P29033 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJB2P29033 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJB2P29033 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJB2P29033 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJB2P29033 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms