Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
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