Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGFR4P22455 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGFR4P22455 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGFR4P22455 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGFR4P22455 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGFR4P22455 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGFR4P22455 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGFR4P22455 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGFR4P22455 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGFR4P22455 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGFR4P22455 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGFR4P22455 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGFR4P22455 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FGFR4P22455 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FGFR4P22455 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FGFR4P22455 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGFR4P22455 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGFR4P22455 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGFR4P22455 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGFR4P22455 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGFR4P22455 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FGFR4P22455 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGFR4P22455 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGFR4P22455 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FGFR4P22455 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGFR4P22455 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGFR4P22455 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGFR4P22455 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGFR4P22455 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGFR4P22455 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGFR4P22455 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGFR4P22455 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGFR4P22455 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FGFR4P22455 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.8 ms