Protein–RNA interactions for Protein: P21953

BCKDHB, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit beta, mitochondrial, humanhuman

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHBP21953 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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BCKDHBP21953 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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BCKDHBP21953 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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BCKDHBP21953 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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BCKDHBP21953 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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BCKDHBP21953 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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BCKDHBP21953 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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BCKDHBP21953 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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BCKDHBP21953 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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