Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms