Protein–RNA interactions for Protein: P18428

LBP, Lipopolysaccharide-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBPP18428 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LBPP18428 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LBPP18428 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LBPP18428 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LBPP18428 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LBPP18428 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LBPP18428 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LBPP18428 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LBPP18428 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LBPP18428 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LBPP18428 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LBPP18428 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LBPP18428 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LBPP18428 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LBPP18428 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LBPP18428 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LBPP18428 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LBPP18428 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LBPP18428 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LBPP18428 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LBPP18428 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LBPP18428 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LBPP18428 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LBPP18428 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LBPP18428 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LBPP18428 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LBPP18428 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LBPP18428 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LBPP18428 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LBPP18428 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LBPP18428 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LBPP18428 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LBPP18428 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LBPP18428 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LBPP18428 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LBPP18428 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LBPP18428 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LBPP18428 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LBPP18428 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LBPP18428 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LBPP18428 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LBPP18428 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LBPP18428 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LBPP18428 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LBPP18428 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LBPP18428 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LBPP18428 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LBPP18428 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LBPP18428 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LBPP18428 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LBPP18428 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LBPP18428 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LBPP18428 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LBPP18428 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LBPP18428 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LBPP18428 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LBPP18428 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LBPP18428 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LBPP18428 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LBPP18428 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LBPP18428 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LBPP18428 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LBPP18428 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LBPP18428 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LBPP18428 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LBPP18428 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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LBPP18428 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LBPP18428 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LBPP18428 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LBPP18428 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LBPP18428 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LBPP18428 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LBPP18428 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LBPP18428 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LBPP18428 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LBPP18428 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LBPP18428 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LBPP18428 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LBPP18428 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LBPP18428 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LBPP18428 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LBPP18428 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LBPP18428 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LBPP18428 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LBPP18428 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LBPP18428 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LBPP18428 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LBPP18428 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LBPP18428 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LBPP18428 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LBPP18428 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LBPP18428 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LBPP18428 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LBPP18428 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LBPP18428 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LBPP18428 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LBPP18428 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LBPP18428 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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