Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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