Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HOXB3P14651 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HOXB3P14651 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB3P14651 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB3P14651 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HOXB3P14651 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB3P14651 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB3P14651 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB3P14651 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB3P14651 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB3P14651 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB3P14651 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB3P14651 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB3P14651 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB3P14651 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB3P14651 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB3P14651 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB3P14651 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB3P14651 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB3P14651 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB3P14651 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB3P14651 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB3P14651 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB3P14651 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB3P14651 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB3P14651 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB3P14651 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB3P14651 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB3P14651 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HOXB3P14651 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB3P14651 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB3P14651 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB3P14651 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB3P14651 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB3P14651 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB3P14651 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB3P14651 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB3P14651 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB3P14651 CCL11-201ENST00000305869 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB3P14651 CEP41-203ENST00000343969 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB3P14651 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB3P14651 XCL2-201ENST00000367819 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB3P14651 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB3P14651 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB3P14651 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HOXB3P14651 BCAS2P3-201ENST00000416374 767 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HOXB3P14651 BX005214.2-201ENST00000423499 1077 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB3P14651 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB3P14651 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB3P14651 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HOXB3P14651 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HOXB3P14651 PMP2-202ENST00000519260 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB3P14651 MTND1P6-201ENST00000523621 946 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HOXB3P14651 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB3P14651 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HOXB3P14651 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB3P14651 AC127522.1-201ENST00000560531 751 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB3P14651 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB3P14651 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB3P14651 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB3P14651 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB3P14651 AC016252.1-201ENST00000609721 474 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HOXB3P14651 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB3P14651 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HOXB3P14651 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB3P14651 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB3P14651 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB3P14651 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB3P14651 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB3P14651 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB3P14651 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB3P14651 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB3P14651 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB3P14651 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB3P14651 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB3P14651 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB3P14651 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB3P14651 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB3P14651 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB3P14651 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB3P14651 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB3P14651 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB3P14651 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB3P14651 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB3P14651 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB3P14651 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB3P14651 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB3P14651 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB3P14651 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB3P14651 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB3P14651 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB3P14651 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB3P14651 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB3P14651 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB3P14651 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB3P14651 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB3P14651 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB3P14651 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HOXB3P14651 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB3P14651 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms