Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP2C9P11712 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms