Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOP08100 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOP08100 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOP08100 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOP08100 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOP08100 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOP08100 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOP08100 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOP08100 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOP08100 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOP08100 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOP08100 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOP08100 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOP08100 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOP08100 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOP08100 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOP08100 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOP08100 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOP08100 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOP08100 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOP08100 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOP08100 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOP08100 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOP08100 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOP08100 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOP08100 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOP08100 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOP08100 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOP08100 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOP08100 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOP08100 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOP08100 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOP08100 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOP08100 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOP08100 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOP08100 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOP08100 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOP08100 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOP08100 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOP08100 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOP08100 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOP08100 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOP08100 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOP08100 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOP08100 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOP08100 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOP08100 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOP08100 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOP08100 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOP08100 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOP08100 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOP08100 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOP08100 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOP08100 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOP08100 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOP08100 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOP08100 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOP08100 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOP08100 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOP08100 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOP08100 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOP08100 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOP08100 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOP08100 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOP08100 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOP08100 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOP08100 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOP08100 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOP08100 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOP08100 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOP08100 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOP08100 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOP08100 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOP08100 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOP08100 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOP08100 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOP08100 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOP08100 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOP08100 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOP08100 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOP08100 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOP08100 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOP08100 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOP08100 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOP08100 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOP08100 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOP08100 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOP08100 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOP08100 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOP08100 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOP08100 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOP08100 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOP08100 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOP08100 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOP08100 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOP08100 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOP08100 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOP08100 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOP08100 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOP08100 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms