Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSLP07711 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSLP07711 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSLP07711 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSLP07711 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSLP07711 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSLP07711 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSLP07711 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSLP07711 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSLP07711 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSLP07711 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSLP07711 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSLP07711 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSLP07711 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSLP07711 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CTSLP07711 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSLP07711 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSLP07711 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSLP07711 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSLP07711 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSLP07711 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSLP07711 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSLP07711 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSLP07711 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSLP07711 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSLP07711 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSLP07711 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSLP07711 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSLP07711 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSLP07711 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSLP07711 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTSLP07711 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTSLP07711 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTSLP07711 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTSLP07711 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTSLP07711 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTSLP07711 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTSLP07711 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTSLP07711 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTSLP07711 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTSLP07711 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTSLP07711 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTSLP07711 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTSLP07711 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTSLP07711 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTSLP07711 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTSLP07711 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTSLP07711 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CTSLP07711 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CTSLP07711 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CTSLP07711 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTSLP07711 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CTSLP07711 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CTSLP07711 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTSLP07711 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTSLP07711 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTSLP07711 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTSLP07711 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTSLP07711 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTSLP07711 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CTSLP07711 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTSLP07711 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CTSLP07711 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CTSLP07711 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CTSLP07711 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CTSLP07711 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CTSLP07711 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CTSLP07711 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.05■□□□□ 0
CTSLP07711 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.05■□□□□ 0
CTSLP07711 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CTSLP07711 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CTSLP07711 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CTSLP07711 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CTSLP07711 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CTSLP07711 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CTSLP07711 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CTSLP07711 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CTSLP07711 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTSLP07711 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTSLP07711 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTSLP07711 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTSLP07711 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTSLP07711 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTSLP07711 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTSLP07711 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTSLP07711 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTSLP07711 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTSLP07711 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTSLP07711 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CTSLP07711 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CTSLP07711 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CTSLP07711 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CTSLP07711 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CTSLP07711 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CTSLP07711 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CTSLP07711 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CTSLP07711 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CTSLP07711 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CTSLP07711 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CTSLP07711 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms