Protein–RNA interactions for Protein: P02675

FGB, Fibrinogen beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGBP02675 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGBP02675 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGBP02675 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGBP02675 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGBP02675 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FGBP02675 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGBP02675 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGBP02675 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGBP02675 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGBP02675 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGBP02675 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGBP02675 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FGBP02675 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGBP02675 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGBP02675 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGBP02675 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGBP02675 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGBP02675 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FGBP02675 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGBP02675 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGBP02675 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGBP02675 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FGBP02675 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGBP02675 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGBP02675 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGBP02675 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGBP02675 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGBP02675 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGBP02675 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGBP02675 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FGBP02675 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGBP02675 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGBP02675 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGBP02675 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGBP02675 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGBP02675 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGBP02675 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGBP02675 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGBP02675 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGBP02675 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGBP02675 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGBP02675 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGBP02675 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGBP02675 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGBP02675 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGBP02675 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGBP02675 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGBP02675 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGBP02675 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGBP02675 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGBP02675 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGBP02675 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FGBP02675 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGBP02675 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGBP02675 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGBP02675 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGBP02675 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGBP02675 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGBP02675 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGBP02675 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGBP02675 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGBP02675 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGBP02675 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGBP02675 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGBP02675 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGBP02675 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGBP02675 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGBP02675 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGBP02675 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGBP02675 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FGBP02675 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGBP02675 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FGBP02675 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGBP02675 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGBP02675 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGBP02675 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGBP02675 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGBP02675 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGBP02675 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGBP02675 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGBP02675 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGBP02675 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGBP02675 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGBP02675 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGBP02675 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGBP02675 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FGBP02675 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGBP02675 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGBP02675 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGBP02675 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGBP02675 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGBP02675 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGBP02675 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGBP02675 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGBP02675 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGBP02675 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FGBP02675 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FGBP02675 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FGBP02675 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FGBP02675 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms