Protein–RNA interactions for Protein: O43868

SLC28A2, Sodium/nucleoside cotransporter 2, humanhuman

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Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A2O43868 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC28A2O43868 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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