Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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MTSS1O43312 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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