Protein–RNA interactions for Protein: O43283

MAP3K13, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 13, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K13O43283 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 AL136981.1-204ENST00000425090 461 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 C2orf80-206ENST00000451346 979 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 AC022274.1-201ENST00000467082 490 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 FAM9C-202ENST00000380625 1122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 DSTNP1-201ENST00000419906 465 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 AC007494.2-201ENST00000563757 764 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP3K13O43283 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms