Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms