Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF419-202ENST00000347466 3654 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LHCGR-201ENST00000294954 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms