Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms