Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms