Protein–RNA interactions for Protein: A6NHC0

CAPN8, Calpain-8, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN8A6NHC0 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN8A6NHC0 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN8A6NHC0 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN8A6NHC0 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN8A6NHC0 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN8A6NHC0 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN8A6NHC0 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN8A6NHC0 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN8A6NHC0 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN8A6NHC0 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN8A6NHC0 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN8A6NHC0 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN8A6NHC0 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN8A6NHC0 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN8A6NHC0 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN8A6NHC0 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN8A6NHC0 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN8A6NHC0 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN8A6NHC0 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN8A6NHC0 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN8A6NHC0 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN8A6NHC0 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN8A6NHC0 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN8A6NHC0 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN8A6NHC0 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN8A6NHC0 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN8A6NHC0 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN8A6NHC0 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN8A6NHC0 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN8A6NHC0 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN8A6NHC0 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN8A6NHC0 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN8A6NHC0 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN8A6NHC0 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN8A6NHC0 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN8A6NHC0 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN8A6NHC0 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN8A6NHC0 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN8A6NHC0 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN8A6NHC0 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN8A6NHC0 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN8A6NHC0 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN8A6NHC0 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN8A6NHC0 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN8A6NHC0 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN8A6NHC0 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN8A6NHC0 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN8A6NHC0 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN8A6NHC0 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN8A6NHC0 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN8A6NHC0 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN8A6NHC0 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN8A6NHC0 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN8A6NHC0 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN8A6NHC0 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN8A6NHC0 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN8A6NHC0 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN8A6NHC0 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN8A6NHC0 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN8A6NHC0 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN8A6NHC0 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN8A6NHC0 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN8A6NHC0 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN8A6NHC0 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN8A6NHC0 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN8A6NHC0 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms