Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.5 ms