Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YWF9

TRBV2, T-cell receptor beta variable 2 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV2A0A0J9YWF9 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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TRBV2A0A0J9YWF9 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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TRBV2A0A0J9YWF9 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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TRBV2A0A0J9YWF9 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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TRBV2A0A0J9YWF9 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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TRBV2A0A0J9YWF9 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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TRBV2A0A0J9YWF9 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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TRBV2A0A0J9YWF9 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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TRBV2A0A0J9YWF9 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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