Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P3

RAI2, Retinoic acid-induced protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAI2Q9Y5P3 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms