Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 C5orf63-203ENST00000509733 553 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 KRT17P4-203ENST00000579355 621 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 AL353997.6-201ENST00000583394 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SETD1BQ9UPS6 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
SETD1BQ9UPS6 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SETD1BQ9UPS6 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SETD1BQ9UPS6 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SETD1BQ9UPS6 AC097381.2-201ENST00000510640 859 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SETD1BQ9UPS6 AC113347.2-201ENST00000512350 279 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
SETD1BQ9UPS6 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SETD1BQ9UPS6 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SETD1BQ9UPS6 AC080013.5-201ENST00000607044 679 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
SETD1BQ9UPS6 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SETD1BQ9UPS6 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SETD1BQ9UPS6 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SETD1BQ9UPS6 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SETD1BQ9UPS6 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SETD1BQ9UPS6 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SETD1BQ9UPS6 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SETD1BQ9UPS6 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SETD1BQ9UPS6 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SETD1BQ9UPS6 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SETD1BQ9UPS6 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SETD1BQ9UPS6 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SETD1BQ9UPS6 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SETD1BQ9UPS6 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SETD1BQ9UPS6 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SETD1BQ9UPS6 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SETD1BQ9UPS6 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SETD1BQ9UPS6 DHDDS-217ENST00000526219 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SETD1BQ9UPS6 FXYD6-208ENST00000529335 708 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SETD1BQ9UPS6 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SETD1BQ9UPS6 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SETD1BQ9UPS6 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SETD1BQ9UPS6 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SETD1BQ9UPS6 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SETD1BQ9UPS6 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SETD1BQ9UPS6 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SETD1BQ9UPS6 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SETD1BQ9UPS6 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SETD1BQ9UPS6 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms