Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL40

ZNF346, Zinc finger protein 346, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF346Q9UL40 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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ZNF346Q9UL40 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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ZNF346Q9UL40 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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ZNF346Q9UL40 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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ZNF346Q9UL40 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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ZNF346Q9UL40 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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ZNF346Q9UL40 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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ZNF346Q9UL40 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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ZNF346Q9UL40 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
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ZNF346Q9UL40 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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ZNF346Q9UL40 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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ZNF346Q9UL40 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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ZNF346Q9UL40 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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ZNF346Q9UL40 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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ZNF346Q9UL40 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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