Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH73

EBF1, Transcription factor COE1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF1Q9UH73 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF1Q9UH73 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms