Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY4

DNAJB4, DnaJ homolog subfamily B member 4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB4Q9UDY4 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJB4Q9UDY4 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms