Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC17A6Q9P2U8 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms