Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

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Length 774 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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HCN3Q9P1Z3 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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HCN3Q9P1Z3 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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HCN3Q9P1Z3 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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HCN3Q9P1Z3 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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HCN3Q9P1Z3 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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HCN3Q9P1Z3 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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HCN3Q9P1Z3 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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HCN3Q9P1Z3 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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HCN3Q9P1Z3 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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HCN3Q9P1Z3 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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HCN3Q9P1Z3 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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HCN3Q9P1Z3 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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